- Nazwa przedmiotu:
- Zaawansowane metody biologii molekularnej w bioanalityce
- Koordynator przedmiotu:
- prof. dr hab. Magdalena Boguta
- Status przedmiotu:
- Obowiązkowy
- Poziom kształcenia:
- Studia II stopnia
- Program:
- Biotechnologia
- Grupa przedmiotów:
- 1. Przedmioty obowiązkowe
- Kod przedmiotu:
- brak
- Semestr nominalny:
- 2 / rok ak. 2009/2010
- Liczba punktów ECTS:
- 3
- Liczba godzin pracy studenta związanych z osiągnięciem efektów uczenia się:
- Liczba punktów ECTS na zajęciach wymagających bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich:
- Język prowadzenia zajęć:
- polski
- Liczba punktów ECTS, którą student uzyskuje w ramach zajęć o charakterze praktycznym:
- Formy zajęć i ich wymiar w semestrze:
-
- Wykład0h
- Ćwiczenia0h
- Laboratorium30h
- Projekt0h
- Lekcje komputerowe0h
- Wymagania wstępne:
- Biochemia, Mikrobiologia, Biologia molekularna, Inżynieria genetyczna.
- Limit liczby studentów:
- Cel przedmiotu:
- Celem ćwiczeń jest zapoznanie studentów z systemami ekspresyjnymi oraz metodami biologii molekularnej stosowanymi do uzyskiwania białek rekombinowanych.
- Treści kształcenia:
- Podczas ćwiczeń studenci nadeksprymują i oczyszczą drożdżowe rekombinowane białko Mrf1 z dołączonym znaczikiem histydynowym (6HIS). Białko Mrf1 jest mitochondrialnym czynnikiem terminacji translacji, niezbędnym do zachowania kompetencji oddechowej. Studenci samodzielnie wykonają wszystkie etapy niezbędne do uzyskania białka rekombinowanego począwszy od projektowania eksperymentu z użyciem narzędzi bioinformatycznych, poprzez klonowanie genu, nadekspresję białka jego oczyszczanie kończąc na analizie czystości produktu.
Studenci wysłuchają wykładów na temat:
1. Systemy nadekspresji białek rekombinowanych.
2. Zarys metod oczyszczania białek rekombinowanych.
3. Zastosowanie białek rekombinowanych w przemyśle i medycynie
W trakcie ćwiczeń będą wykorzystywać następujące techniki:
- reakcja PCR;
- trawienie DNA enzymami restrykcyjnymi;
- ekektoforeza DNA w żelu agarozowym;
- ekektoforeza białek w żelu poliakrylamidowym w warunkach denaturujących (SDS-PAGE);
- detekcja białek – barwienie błękitem Coomasie;
- transformacja bakterii;
- izolacja plazmidowego DNA z bakterii;
- hodowla bakterii w warunkach indukcji;
- chromatografia powinowactwa z użyciem Nikiel-agarozy.
- Metody oceny:
- kolokwium
- Egzamin:
- Literatura:
- Publikacje przekazane przez prowadzących
- Witryna www przedmiotu:
- Uwagi:
Efekty uczenia się